Вы получаете эту ошибку, так как пытаетесь импортировать функционал из модуля mmcif-pdbx, но этот модуль не был установлен в Вашем python окружении.


Чтобы установить модуль, напишите в терминале:

 pip install mmcif-pdbx

Установка python пакета mmcif-pdbx при помощи pip

Чтобы установить модуль в интерактивной среде инструментов Google Colab, Kaggle/Jupyter Notebook или ipython, запустите такую ячейку/строчку:

 !pip install mmcif-pdbx

Наиболее точную и подробную информацию об установке пакета mmcif-pdbx можно найти в индексе пакетов Python: https://pypi.org/project/mmcif-pdbx/, а об установке пакетов вообще - в документации python.


А теперь немного деталей:

pip - это стандартный пакетный менеджер для python. Эта программа должна установить недостающий пакет в Вашем окружении / текущей сессии Google Colab, Kaggle/Jupyter Notebook или ipython.

! - восклицательный знак в интерактивных оболочках (таких, как ipython) применяется для отправки команд не в интерпретатор python, а в shell оболочку. В ней исполняются команды вроде cd, ls, pwd, и в том числе pip. Вот статья на Хабре про основы работы в shell оболочке